多模态跨尺度生物医学成像设施是国家发展改革委“十三五”时期布局建设的国家重大科技基础设施，主要建设多模态医学成像、多模态活体细胞成像、多模态高分辨分子成像、全尺度图像数据整合、模式动物与样品制备等子系统及配套工程，通过全尺度图像整合系统实现有机连接，形成跨尺度、多模态、自动化和高通量的生物医学成像全功能研究平台，对生命体结构与功能进行跨尺度可视化描绘与精确测量，而有望破解生命与疾病的奥秘。

设施建成后，成像设施可提供大脑结构与功能成像、神经网络成像、心脑血管造影、组织成像、模式动物活体成像、活细胞/亚细胞结构与功能成像、生物大分子结构解析、成像大数据融合、解析与挖掘等研究手段，支撑脑科学与认知科学、神经系统疾病、心脑血管疾病、生殖与发育、干细胞与再生、肿瘤的精准诊断等国家生命科学领域的重大研究。